آزمایشگاه کنترل  میکروبی مواد غذایی به متراژ ۶۳ متر مربع جهت آموزش دانشجویان آزمایش های میکروبی متنوعی بر روی نمونه های مواد غذایی و سطوح در تماس با مواد غذایی در حال فعالیت است، در این آزمایشگاه کلاس عملی درس میکروبیولوژی مواد غذایی برای دانشجویان کارشناسی تغذیه،دانشجویان کارشناسی ارشد بهداشت و ایمنی مواد غذایی برگزار می گردد.همچنین دارای امکانات لازم جهت انجام پروژه و پایان نامه دانشجویان کارشناسی ارشد بهداشت و ایمنی مواد غذایی، کارشناسی ارشد و دکتری تغذیه می باشد.